JULIA se reencuentra con SPIKE en un viejo cementerio, los recuerdos de pasión y traición fluyen en sus mentes, pero las ganas de estar juntos es más fuerte, de repente se encuentran en una gran cacería humana: ANNIE ha sido asesinada y JULIA esta en la mira de los asesinos y de repente... un disparo repercute en la azotea. SPIKE cegado por la furia decide enfrentarse por última vez con VICIOUS, quien lo está esperando para entablar EL DUELO DEFINITIVO...
VICIOUS decide tomar las riendas de la Organización mafiosa RED DRAGON y da un golpe letal a los viejos directivos de esta. SPIKE enterado de esto decide poner cartas en el asunto y reanudar la búsqueda de JULIA. Mientras tanto en el aeropuerto FAYE ayuda a una mujer perseguida por una banda de mafiosos, resultando ser JULIA el pasado de SPIKE.
Repentinamente las dos chicas de la Bebop cambian el curso de la Nave para ir a la Tierra, por su parte ED se encuentra con su padre APPLEDELHI SINIZ HESAP LUFEN y FAYE va en busca de su antigua casa que ha visto filmada en la video cinta. Inesperadamente el destino de ambas chicas les sale al cruce y deberán decidir si se quedan en la BEBOP o reencauzan sus vidas.
SPIKE comienza la cacería sobre TED BOWER apodado TEDDY BOMBER el cual pone bombas en las grandes almacenes galácticos, la peculiaridad de TEDDY es que coloca sus bombas dentro de tiernos ositos de peluche. Tras la Cacería SPIKE se topa con un tipo montando a caballo llamado ANDY el cual se hace llamar Verdadero cowboy, es entonces cuando comienza la gran cacería y sólo uno de los dos dará con la presa: el Mejor Cowboy.
PAO un viejo conocido de JET, parece haber muerto, un mensaje conduce a éste a encontrarse con MEIFA hija de PAO y juntos comienzan la búsqueda de un extraño objeto, el cual tiene que ver con los accidentes de las puertas espaciales y la presunta desaparición de PAO. Finalmente este extraño objeto que posee efectos sobrenaturales revela un gran misterio.
MAD PIERROT es una máquina de matar decide vengarse de los miembros del ISSP, éste jamás ha dejado a un testigo de sus asesinatos con vida, pero el único que escapa es SPIKE. El payaso sicótico invita a SPIKE a un macabro parque de diversiones dándole la paliza de su vida, SPIKE prácticamente con un hilo de vida encuentra el punto débil del payaso.
GEORGE, HARMAN y RUTH tienen una banda la cual gusta robar naves espaciales para venderlas en el mercado negro. Mientras SPIKE va donde su viejo amigo DOOHAN el que le regalo su nave el SWORDFISH II para que se la repare, los piratas se topan con la BEBOP y la ponen fuera de combate infectándola con un virus informático a través de un arpón. El combate aéreo será inevitable y solamente con un poco de ayuda lograrán salir adelante.
Un extraño paquete a nombre de FAYE llega a la Nave, al abrirlo nadie sabe lo que es ese oscuro objeto, finalmente ED descubre que es una cinta de video. Muertos de curiosidad JET y SPIKE tratan de conseguir un aparato para reproducir la cinta, para colmo la cinta no es VHS es BETA, éstos se meten en más de un problema, pero, al reproducir la cinta ¿Quién es esa niña que está en la Tierra?
La BEBOP está en el espacio sin carburante, para colmo los tripulantes de ésta están muriendo de hambre y la reserva de comida ha sido robada por uno de ellos. De repente la nave es colisionada por otra nave cayendo la BEBOP a la Tierra. JET, FAYE y SPIKE con las pocas fuerzas que le quedan reparan la nave y ED y EIN salen en busca de comida. Unos extraños hongos son todo lo que ED encuentra y tras comerlos cada miembro de la tripulación emprende un alucinante viaje.
WITNEY HAGAS MATSUMOTO fue el primer hombre que vio a FAYE salir de su estado de hibernación en una unidad criogénica hospitalaria. Su memoria estaba en blanco y lo único que recuerda es el sacrificio que ese hombre hizo por ella al morir por defenderla. La sorpresa es mayúscula cuando JET llega con su nueva presa el hombre que supuestamente murió por amor.
CHESSMASTER HEX un viejo cuyo único pasatiempo es jugar ajedrez, en su pasado trabajo en la construcción de los puertos espaciales que posibilitan los viajes a través del espacio, pero tras el desarrollo de las mismas es despedido, éste decide crear un plan para vengarse y después de 50 años se cumple su objetivo, pero a pesar de los tripulantes de la BEBOP HEX ni siquiera recuerda su venganza sólo quiere jugar, jugar y jugar ajedrez.
FAYE se ha ido de la BEBOP y se va a un planeta llamado CALIXTO donde no vive ni siquiera una mujer, ED traba de buscarla usando su habilidad de hacker pero descubre el paradero de JULIA, es entonces cuando SPIKE parte en busca de JULIA y JET de FAYE. Para colmo SPIKE se vuelve a encontrar con VICIOUS y LIN su mano derecha el cual dispara contra el dejándolo tirado en el suelo.
Esta Vez JET decide ir a GANÍMEDES y arreglar unos asuntos de tipo sentimental con una mujer que en su juventud lo abandonó. El pobre de JET no sólo empeorará las cosas con su ex sino que se llevara una sorpresa al saber que su siguiente presa es RHINT CELONIAS actual novio de esa mujer.
